PhpStorm braucht eine ganze Menge Speicher. Unter MacOS kann beim Indexieren große Projekte schon mal der Speicher knapp werden. Einfach im Ordner Programme den Paketinhalt von PhpStorm anzeigen lassen,

unter Contents navigieren und die Info.plst öffnen.

Folgenden Eintrag ändern und freuen:

-Xms128m -Xmx1400m -XX:MaxPermSize=350m -XX:ReservedCodeCacheSize=64m -XX:+UseCompressedOops